Ведомство было создано 16 марта 1937 года для защиты социалистической собственности в составе Главного управления рабоче-крестьянской милиции и называлось ОБХСС. Одним из наиболее важных исторических этапов этой службы стали 70-80-е годы минувшего столетия. Тогда борьба со скрытыми хищениями, а также с преступлениями в крупных и особо крупных размерах велась особенно активно. К середине 80-х годов служба ОБХСС вышла в число ведущих. После распада Советского Союза правоохранительное ведомство Беларуси самостоятельно определяло приоритеты и разрабатывало новые методики работы.
Сегодня основные усилия сотрудников УБЭП сосредоточены на выявлении и раскрытии злодеяний в сфере экономики, пресечении фактов коррупции и возмещении материального ущерба, причиненного правонарушениями в экономической системе.